Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF1Q12946 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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