Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms