Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SREBF2Q12772 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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