Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE4DQ08499 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms