Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RPL26L1-201ENST00000265100 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL117382.1-201ENST00000438702 754 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RPL26L1-206ENST00000521476 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms