Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFI35P80217 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFI35P80217 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms