Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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