Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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