Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP1P29466 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP1P29466 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP1P29466 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms