Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms