Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRHP20396 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRHP20396 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRHP20396 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRHP20396 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRHP20396 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRHP20396 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRHP20396 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRHP20396 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRHP20396 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRHP20396 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms