Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms