Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms