Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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