Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms