Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSPG5O95196 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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