Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CREB3O43889 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms