Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf172C9J069 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms