Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TMED7Q9Y3B3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms