Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms