Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms