Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PHACTR1Q9C0D0 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHACTR1Q9C0D0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms