Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms