Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms