Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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ECHDC3Q96DC8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ECHDC3Q96DC8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ECHDC3Q96DC8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ECHDC3Q96DC8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ECHDC3Q96DC8 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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