Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL355312.2-201ENST00000455607 1541 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RPSAP34-201ENST00000476193 736 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC116345.1-202ENST00000513379 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 BOLA3P1-201ENST00000530713 355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL117192.1-204ENST00000553485 449 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 OLFML3-201ENST00000320334 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 FAM209A-201ENST00000371328 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ZNF277-206ENST00000450657 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms