Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SLC9A4Q6AI14 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A4Q6AI14 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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