Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL38Q2WGJ6 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms