Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HADHQ16836 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms