Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK5Q16478 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK5Q16478 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms