Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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SEC23BQ15437 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SEC23BQ15437 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SEC23BQ15437 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SEC23BQ15437 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SEC23BQ15437 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SEC23BQ15437 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SEC23BQ15437 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC23BQ15437 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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