Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GOLGA4Q13439 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.5 ms