Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLD1Q13393 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms