Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms