Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEX3Q00994 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms