Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAD23AP54725 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms