Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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