Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTHFRP42898 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms