Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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