Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNB1P01574 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms