Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms