Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms