Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TCAF1Q9Y4C2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms