Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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