Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IGSF9BQ9UPX0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms