Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERVK-5Q9HDB9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms