Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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