Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms