Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK5RAP3Q96JB5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms