Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms